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アイテム
Tanimoto係数を用いた類似化合物検索のクラスタリングによる高速化手法
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/68046
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/680462006702a-bd71-4c77-b342-42e8b29d04e4
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO10020007.pdf (503.3 kB)
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Copyright (c) 2010 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2010-02-25 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | Tanimoto係数を用いた類似化合物検索のクラスタリングによる高速化手法 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | A method to speedup compound searching by grouped similar compounds using the Tanimoto coefficient | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学基礎工学部情報科学科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Information and Computer Science School of Engineering Science, Osaka University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University | ||||||||
| 著者名 |
グエンカムリー
× グエンカムリー
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| 著者名(英) |
Nguyen, CamLy
× Nguyen, CamLy
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 医薬品開発の大きな課題の一つとして，新たな薬の候補となる化合物を効果的に発見するため，化合物集合の中から特定のタンパク質に作用する可能性のある候補化合物を計算機によって探索する過程がある．候補化合物の探索には化合物の構造類似性が用いられていることが多いがデータベースに登録されている化合物量が日々増加しており，類似化合物検索の高速化が必要とされている．本研究では，化合物の部分構造情報を数値化した構造キーと，その類似尺度の一つとして Tanimoto 係数を用いた高速な類似化合物検索方法を提案する．提案手法では，化合物集合をクラスタリングするより類似化合物検索を高速化する．また，提案手法を従来手法と比較し，提案手法を評価する． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | In order to find compounds as candidates for drugs, one of the major problems of drug development, it is necessary to find compounds that might affect the proteins by using computer. Analysis of the compound structure similarity is a widely used method to discover candidate compounds. Nowadays, as the volume of compounds database is becoming rapidly increased, it is important to accelerate the compounds searching. In this paper, we propose a method to speed up compound searching by using structure key and Tanimoto coefficient. We use some methods for grouping similar compounds and evaluate our method by comparing it with the algorithm normally used. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2010-BIO-20, 号 7, p. 1-8, 発行日 2010-02-25 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
