| Item type |
SIG Technical Reports(1) |
| 公開日 |
2015-06-16 |
| タイトル |
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タイトル |
海洋環境解析に向けたメタゲノムおよび1細胞配列データ解析用パイプラインの開発 |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
| 著者所属 |
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京都大学iPS細胞研究所 |
| 著者所属 |
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京都大学iPS細胞研究所 |
| 著者所属 |
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三菱総合研究所 |
| 著者所属 |
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早稲田大学理工学術院 |
| 著者所属 |
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早稲田大学理工学術院 |
| 著者所属 |
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京都大学化学研究所 |
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早稲田大学理工学術院 |
| 著者所属 |
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京都大学iPS細胞研究所 |
| 著者所属(英) |
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en |
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Kyoto University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Kyoto University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Mitsubishi Research Institute |
| 著者所属(英) |
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en |
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Waseda University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Waseda University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Kyoto University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Waseda University |
| 著者所属(英) |
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en |
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Kyoto University |
| 著者名 |
小林, 健太
加藤, 有己
谷口, 丈晃
丸山, 徹
伊藤, 通浩
五斗, 進
竹山, 春子
藤渕, 航
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| 論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
多数の難培養微生物で構成される海洋環境の理解を促進するために，メタゲノム解析に注目が集まっている．しかしながら，メタゲノムのリード群を完全にアセンブルすることは困難を極めることが知られている．近年，次世代シークエンシング技術の発展とともに，1 細胞ゲノムデータが利用できるようになってきた．本稿では，近年の利用可能な技術の動向を踏まえ，メタゲノムおよび 1 細胞配列データが与えれたとき，アセンブリ，遺伝子の構造および機能推定を行うパイプラインを発表する．具体的に，リードの前処理，アセンブリとアノテーションに特化したパイプラインを提供し，遺伝子アノテーションのマップの可視化を可能とするものである． |
| 書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12055912 |
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO）
巻 2015-BIO-42,
号 58,
p. 1-2,
発行日 2015-06-16
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| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8590 |
| Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
| 出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |
IPSJ-BIO15042058.pdf (260.5 kB)
