| Item type |
SIG Technical Reports(1) |
| 公開日 |
2017-03-16 |
| タイトル |
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タイトル |
コンテナ型仮想化による分散計算環境におけるタンパク質間相互作用予測システムの性能評価 |
| タイトル |
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言語 |
en |
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タイトル |
Evaluation of Container Virtualized MEGADOCK System in Distributed Computing Environment |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
| 著者所属 |
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東京工業大学情報理工学研究院情報工学系／東京工業大学博士課程教育リーディングプログラム情報生命博士教育院 |
| 著者所属 |
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東京工業大学情報理工学研究院情報工学系／東京工業大学博士課程教育リーディングプログラム情報生命博士教育院 |
| 著者所属 |
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東京工業大学情報理工学研究院情報工学系／東京工業大学科学技術創成研究院スマート創薬研究ユニット |
| 著者所属 |
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東京工業大学情報理工学研究院情報工学系／東京工業大学博士課程教育リーディングプログラム情報生命博士教育院／東京工業大学科学技術創成研究院スマート創薬研究ユニット |
| 著者所属(英) |
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en |
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Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology / Education Academy of Computational Life Sciences, Tokyo Institute of Technology |
| 著者所属(英) |
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en |
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Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology / Education Academy of Computational Life Sciences, Tokyo Institute of Technology |
| 著者所属(英) |
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en |
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Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology / Advanced Computational Drug Discovery Unit, Institute of Innovative Research, Tokyo Institute of Technology |
| 著者所属(英) |
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en |
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Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology / Education Academy of Computational Life Sciences, Tokyo Institute of Technology / Advanced Computational Drug Discovery Unit, Institute of Innovative Research, Tokyo Institute of Technology |
| 著者名 |
青山, 健人
山本, 悠生
大上, 雅史
秋山, 泰
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| 著者名(英) |
Kento, Aoyama
Yuki, Yamamoto
Masahito, Ohue
Yutaka, Akiyama
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| 論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
近年，軽量かつ性能に優れた仮想化技術としてコンテナ型仮想化が大規模な並列計算環境に導入されはじめている．様々なライブラリやソフトウェア群を併用する機会の多い生命情報解析分野において，ライブラリや実行ファイルを既存の環境から隔離し，即時実行可能な形式でソフトウェア共有を可能とするコンテナ型仮想化技術は，大きな影響を与えると予測される．本研究では，我々の研究室で開発したタンパク質間相互作用予測システム （MEGADOCK） について，クラウド環境上の仮想マシンにコンテナ型仮想化の実装の 1 つである Docker を用いた分散計算環境を構築し，並列計算性能を評価する． |
| 論文抄録(英) |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
Container virtualization, is a lightweight and superior performance virtualization technology, has begun to be introduced into a large-scale parallel computing environment. In the bioinformatics field, where there are many opportunities to combine various libraries and binary files, container virtualization technology that isolates the existing software environment and enables rapidly software distribution in an immediate executable format is expected to have many effects. In this study, we have selected the Docker which is an implementation of container virtualization, constructed the distributed computing environment of a protein-protein interaction prediction system (MEGADOCK) in virtual machines on cloud computing environment, and have evaluated the results of parallel computing performance. |
| 書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12055912 |
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO）
巻 2017-BIO-49,
号 3,
p. 1-8,
発行日 2017-03-16
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| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8590 |
| Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
| 出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |
IPSJ-BIO17049003.pdf (965.4 kB)
